Los apasionados del senderismo tienen en Ensenada cuatro rutas formarles de senderos balizados para practicar a placer esta actividad en escenarios boscosos rodeados de fauna endémica. En el Parque Nacional de San Pedro Mártir está el sendero El Pacífico trazado a manera de circuito, tiene una distancia de un kilómetro y su nivel es ligero. También está Mirador de Altar un sendero de clase 2 que se disfruta un poco más de 4 kilómetros en un tiempo aproximado de tres horas. Las vistas del Golfo de Cortés y del Pacífico son increíbles.

Al noroeste de Ensenada, el Bosque de las Attenuatas con su bello paisaje de montaña regala un sendero de nivel medio –no apto para principiantes– tiene una distancia de 6 kilómetros y el tiempo destinado para su recorrido es de tres horas. Acompñado de humedales, el sendero estero La Misión se ha diseñado para todos los niveles de habilidad, los 4 kilómetros de distancia se recorren en una hora. Quien desee, puede ir acompañado de su perro.