Una de las construcciones más antiguas de Atlixco. Ahí donde antes habitaron los carmelitas descalzos hoy existen un par de museos. El primero es el Museo de las Culturas del Valle de Atlixco, donde se exhiben objetos prehispánicos pertenecientes a distintas regiones de los alrededores. Además hay una sala dedicada al festival Huey Atlixcáyotl con muestras de la indumentaria usada durante la fiesta. En la parte de arriba del convento se halla el Museo de Santa Clara, un interesante espacio de arte sacro de principios del Virreinato.